边境地区出口企业未按照本项规定办理代理报关备案登记、备案核销的，将会受到主管税务机关如何处理？

一、根据《国家税务总局关于＜出口货物劳务增值税和消费税管理办法＞有关问题的公告》（国家税务总局公告2013年第12号）第五条第十项第5目规定：“边境地区出口企业未按照本项规定办理代理报关备案登记、备案核销的，主管税务机关可取消其按照代理报关备案管理的资格，并可按《中华人民共和国税收征收管理法》第六十二条等有关规定处理。”
二、根据《中华人民共和国税收征收管理法》（中华人民共和国主席令第49号）规定：“第六十二条 纳税人未按照规定的期限办理纳税申报和报送纳税资料的，或者扣缴义务人未按照规定的期限向税务机关报送代扣代缴、代收代缴税款报告表和有关资料的，由税务机关责令限期改正，可以处二千元以下的罚款；情节严重的，可以处二千元以上一万元以下的罚款。”